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派出所废柴警员菊川玲二（生田斗真）某天突然被开除，并被安插至超级危险的犯罪组织去进行卧底调查，也就是成为所谓的“鼹鼠”。他成为了黑社会“数寄矢会”的一员，经历数次生死劫难后，并未暴露身份，成功摆脱了处男之身，还和“疯蝴蝶”（堤真一）结下了生死之交。
在那之后，嫉恶如仇的警视厅组织犯罪对策部精英兜真矢（瑛太）上任，他为了清除警察和黑社会间的勾结关系，把玲二当成了自己最大的目标。此时玲二从轰周宝（岩城滉一）那里得到了一个“重要任务”——打倒胡作非为的中国黑手党“仙骨龙”，并担任周宝的女儿，奇迹般仍是处女的轰迦莲（本田翼）的贴身护卫。
这意想不到的任务让玲二在警察内部和海外都遭遇巨大危机。而所有一切的背后，一场席卷全日本的巨大阴谋正在悄悄发动……